邓小平的上升，引起野心家林彪的极度不安。文化大革命开始后，邓小平一家经历了无数的凌辱和折磨，遭受了林彪一伙的残酷迫害。邓小平被污蔑为“中国第二号走资本主义道路的当权派”，家中无数次被“红卫兵”查抄。1967年9月13日，邓小平的五个子女被迫离开中南海，先是在各自的学校挨批斗，后来都被赶出学校，邓朴方就是在此时致残的。

1969年春，党的“九大”召开，在“文革”中语录不离手、万岁不离口的林彪当上了党中央惟一的副主席。这意味着毛泽东为统帅、林彪为副统帅的“无产阶级司令部”已经彻底摧毁了以刘少奇为首、邓小平为副的“资产阶级司令部”。

随着“胜利”的到来，林彪利令智昏，背着党中央和毛泽东，以苏联要突然袭击北京为借口，擅自发布“紧急指示”，调动全军进入紧急战备状态。这便是臭名昭著的“林彪一号令”。这个“林彪一号令”，实质上是林彪图谋政变的一次预演，他要检验自己“副统帅”的号令灵不灵。同时，通过“一号令”，以战备疏散为名，把军队的老同志赶出北京，为实现他篡党夺权的阴谋扫除障碍。

于是，朱德、李富春被迫流放到广东从化县，陈毅被“疏散”到了石家庄，叶剑英被赶到长沙，聂荣臻无奈去了邯郸，刘少奇被押送到开封，陶铸被押送去了合肥，邓小平被流放到了江西新建县。1969年10月26日，一辆载着邓小平、卓琳和继母夏伯根的汽车开出了中南海。邓小平怀着沉重的心情，凝视着怀仁堂的寂静，离开了居住十七年的中南海。

周恩来启贤邓小平二进中南海 毛远新进馋邓小平二出中南海