1989年11月6日，中共十三届五中全会在北京召开。刘华清以中顾委委员的身份列席了会议。

会议开幕的当天，印发了军委主席邓小平9月4日与中央政治局常委江泽民、李鹏、乔石、姚依林、宋平、李瑞环以及杨尚昆、万里等同志的谈话要点。中心内容是：邓小平主动提出辞去中央军委主席职务；提名江泽民任军委主席，杨尚昆兼任副主席，刘华清任副主席，杨白冰任军委秘书长。

要点稿基本上是记录整理的邓小平的原话。邓小平说：“党要管军队，因为军队始终是党的。”“军队是党的军队，当然也是国家的军队。”“我们军队要成为一个听党的话的军队。

我们的传统是军队不能搞集团，不能搞小圈子，不能权力集中在几个人身上，军队任何时候都要听中央的话，听党的话，选人也是要选听党的话的人。

军队不能打自己的旗帜，所以，既然变动军委主席，也要考虑军委组成人员和工作机构问题，连同我的问题一同解决比较好。我提议江泽民当军委主席。江泽民同志过去与军队联系少一些，但也不是没有联系，他当主席比较顺。”

关于军委以后的工作，邓小平说：“主席要有助手，就是副主席、秘书长。有两三个助手，他这个主席就好当了。有事可以找人办，否则什么事情都要主席出面那受不了。军队工作也是很多的呀！

尚昆这届不退，现在一下变动太多不好，稳定军队是很重要的。刘华清当副主席，杨白冰当秘书长。刘华清身体好，知识面比较宽，解放后一直搞国防工业，搞科技装备，在苏联还学了几年。